性能方面，iQOONeo9和荣耀90GT同样搭载了骁龙8Gen2上一代旗舰处理器，不同的是，荣耀90GT还配备了一颗独显，而iQOONeo9则另配备了一颗自研电竞芯片Q1。从体验上看，这颗Q1电竞芯片在功能方面远超一般的独显芯片是没问题，同时，iQOONeo9还拥有6043mm²的VC液冷散热，略大于荣耀90GT的5268mm²。由此，在实际游戏体验中，iQOONeo9要略占优势。
屏幕方面，iQOONeo9采用2800*1260分辨率的6.78英寸OLED直屏，支持144Hz的自适应高刷，局部峰值亮度3000nit，支持2160Hz的PWM高频调光;荣耀90GT采用的是2664*1200分辨率的6.7英寸京东方OLED柔性直屏，支持120Hz的自适应高刷，局部峰值亮度2600nit，支持3840Hz的PWM高频调光。从参数上看，荣耀90GT在超高频PWM调光，护眼等级方面更占优;iQOONeo9则在旗舰级的LTPO、屏幕功耗更低，以及2000Hz瞬时触控游戏场景下有一定优势。
影像方面，两款机型都配备了1600万像素前摄，后摄方面，iQOONeo9配备的是5000万像素主摄(IMX920，1/1.49英寸，OIS光学防抖)+800万像素超广角双摄组合;荣耀90GT则配备5000万像素主摄(IMX906，1/1.56英寸，OIS光学防抖)+1200万像素超广角双摄组合。相比之下，iQOONeo9这颗与vivoX100同款的主摄，再加上自研VCS仿生光谱技术，无论进光量还是成片素质表现都要更有优势，而在超广角方面，荣耀90GT则明显更有优势。
电池和充电方面，荣耀90GT内置的是5000mAh的电池，并支持100W快充技术。这样的配置可以确保手机有着较长的续航能力，并能在短时间内迅速充电。相比之下，iQOONeo9内置了更大的5160mAh电池，并配备了功率更高的120W快充技术，这不仅提供了更长的使用时间，同时也能在更短的时间内充满电，这对于经常外出或快节奏生活的用户尤为方便。
外观设计方面，iQOONeo9后摄模块采用双环设计，机身采用直角边框设计，塑料中框加玻璃/素皮材质后盖材质，机身厚7.99mm，重196g/8.34mm，重190g(红白魂)，有格斗黑、红白魂、航海蓝三种配色;荣耀90GT后摄模块采用矩形设计，同样机身采用直角边框设计，全塑料机身，厚7.9mm，重185g，有星耀黑、燃速金、GT蓝三种配色。
其他方面：
荣耀90GT采用荣耀自研射频芯片C1，信号更稳定。
iQOONeo9预装OriginOS4系统，荣耀90GT预装系统。
iQOONeo9配备了红外接口，荣耀90GT没有。
另外，两款机型都配备有蓝牙5.3版本、立体声双扬声器、X轴线性马达以及NFC等。
总体来看，iQOONeo9相比荣耀90GT，屏幕运行更流畅，拍照效果更好，续航时间更长，有线充电速度更快，还搭载自研电竞引擎Q1，价格更便宜;喜欢打游戏、拍照，对续航和充电有更高要求的消费者可以考虑iQOONeo9;而荣耀90GT相比iQOONeo9，机身更轻薄、屏幕更护眼、网络信号更稳定，喜欢轻薄机身、考虑护眼和信号的消费者，倒是可以考虑这款。不过从性价方面考虑，iQOONeo9要更便宜三四百元，所以值得优先考虑。
